俱乐部前身为成立于2009年的白云山和黄中药足球俱乐部。国务院特殊津贴专家、广东省政协科教卫体委员会副主任、白云山制药股份公司董事长兼白云山和黄总经理李楚源针对中国足球状况提出了“中药足球，足球中药”理念，积极引入中医药经典理论与先进理念给中国足球发展献计献策，并从中医药伟大宝库中开发“足球中药”神奇秘方提高足球队员的竞技水平，从物质与精神两个层面积极推动中国足球的振兴,实现中医药和足球事业的双振兴。俱乐部聘请了知名足球教练周穗安、岳永荣为顾问，以普及和提高我国足球运动为己任，前后举办2009年吉林长春白领周末联赛、广东省“白云山凉茶杯”医药界周末联赛、武汉业余足球争霸赛、2010年“口炎清杯”中药足球模拟世界杯联赛等。

同时，在“中药足球”的理念指引下，俱乐部还联合中国足球协会举行了“健康校园，快乐足球”等一系列公益活动，让足球为孩子送去真正的快乐，为中国足球未来培养后备力量。

“白云山”是我国从事职业足球最早的企业，1988年中国第一支企业赞助的职业化球队诞生于白云山。在2011-2012赛季，白云山和黄中药足球俱乐部正式更名为“白云山足球俱乐部”，并重拾俱乐部标识，积极推动申办五人足球世界杯，争取在五人足球领域再创辉煌。